我校在高原鱼类资源调查与保护研究中取得新进展

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南湖新闻网(记者李俊)近日,我校水产学院在高原鱼类资源调查与保护方面取得新进展,并在国际知名生态期刊《Molecular Ecology Resources》上发表了题为《The chromosome-level genome assembly of Triplophysa tibetana, a fish adapted to the harsh high-altitude environment of the Tibetan plateau》的研究论文。

高原鳅是世界上海拔最高的鱼类,其中大部分是青藏高原特有的。西藏高原鳅(Triplophysa tibetana),生活在海拔4000米的高原水域,是研究高原水域极端环境适应性的理想物种。本研究采用PacBio测序和高-碳技术组装625Mb基因组,重叠群N50长度为2.9Mb,共获得25条染色体,染色体安装率为98.7%。预测了个编码蛋白质。通过比较基因组学,发现西藏泥鳅和斑马鱼在1.214亿年前就与它们的共同祖先发生了分化。组装好的高质量染色体基因组为后续研究提供了有价值的信息,为研究鱼类在高海拔地区的极端环境适应性提供了新的平台。

本研究由我校水产研究所牵头,由西藏农业科学院水产研究所、武汉理工大学计算机科学学院、菲沙基因、广州大学生物科学研究所项目组成员共同完成。杨学芬副教授,博士。马志宏和西藏研究所研究员刘海平是合着者,杨瑞斌副教授是通讯作者。

点评者:杨瑞斌

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